More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2337 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2337  ABCMn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
280 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1627  ABC-3 protein  98.21 
 
 
280 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1532  ABC-3 protein  96.43 
 
 
280 aa  437  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1537  ABC-3 protein  85.5 
 
 
279 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.594974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3921  ABC-3 protein  41.7 
 
 
296 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  32.08 
 
 
277 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.2 
 
 
266 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  29.63 
 
 
287 aa  92  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  31.95 
 
 
277 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
277 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.58 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  31.58 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  31.58 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  31.58 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  31.58 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  28.35 
 
 
285 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  28.29 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  28.11 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  25.1 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  29.92 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  31.42 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  24.32 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  24.32 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  31.52 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  27.24 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  25.39 
 
 
288 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  27.03 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  35.63 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  31.78 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  27.54 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  32.39 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  25.1 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  28.19 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  27.12 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  29.94 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.09 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.04 
 
 
279 aa  72  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  30.83 
 
 
466 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  29.73 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  26.67 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  27.27 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  25.67 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  33.69 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  27.8 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0373  ABC transporter protein  32.74 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  26.46 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  23.13 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  23.13 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  28.63 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  28.41 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  30.43 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  23.53 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  25.6 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  27.95 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  32.81 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  34.03 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  28.21 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  26.48 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  26.27 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  28.51 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  27.82 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  27.82 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  30.15 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  29.27 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  29.17 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  23.81 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  29.17 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  23.81 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  27.14 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.15 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  30.05 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.15 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  27.52 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  28.75 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  30.8 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  30.93 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  26.42 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  24.31 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  25.65 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  18.58 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  31.92 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  26.92 
 
 
299 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  27.6 
 
 
261 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30 
 
 
277 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  27.6 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  27.6 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  27.6 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  27.6 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  27.2 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  27.82 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>