48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3849 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  100 
 
 
815 aa  1618    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  47.06 
 
 
822 aa  677    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  47.57 
 
 
726 aa  598  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  24.64 
 
 
786 aa  118  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  24.51 
 
 
821 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  24.87 
 
 
823 aa  115  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  26.67 
 
 
793 aa  114  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  22.31 
 
 
728 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  24.07 
 
 
784 aa  107  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  22.34 
 
 
819 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  27.57 
 
 
798 aa  97.8  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  30.03 
 
 
825 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  30.39 
 
 
810 aa  95.5  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  24.38 
 
 
788 aa  93.6  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  27.85 
 
 
901 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  28.64 
 
 
809 aa  88.2  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  24.02 
 
 
812 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  28.43 
 
 
800 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  28.42 
 
 
836 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  29.61 
 
 
819 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  28.81 
 
 
830 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  23.82 
 
 
795 aa  81.3  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  23.28 
 
 
818 aa  80.9  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.43 
 
 
801 aa  80.9  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  31.15 
 
 
801 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  29.24 
 
 
801 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  26.79 
 
 
825 aa  77.8  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  26.16 
 
 
821 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  30.39 
 
 
840 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  28.35 
 
 
839 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  28.5 
 
 
1047 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  23.77 
 
 
847 aa  62.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  24.76 
 
 
886 aa  62  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  22.51 
 
 
809 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  26.7 
 
 
1045 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  40.98 
 
 
856 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3982  hypothetical protein  28.46 
 
 
1024 aa  58.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0823413  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  27.9 
 
 
744 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  28.8 
 
 
962 aa  55.1  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  25.64 
 
 
892 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  30.86 
 
 
894 aa  52.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  38.2 
 
 
1140 aa  51.2  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  30.23 
 
 
796 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2238  hypothetical protein  31.75 
 
 
1011 aa  48.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  24.69 
 
 
888 aa  47  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1023  hypothetical protein  27.86 
 
 
847 aa  45.8  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.546807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  25.8 
 
 
869 aa  45.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0490  hypothetical protein  24.22 
 
 
752 aa  44.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.274799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>