11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3982 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3982  hypothetical protein  100 
 
 		 1024 aa  2034    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0823413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  24.92 
 
 		 798 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  28.46 
 
 		 815 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  24.21 
 
 		 825 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  27.7 
 
 		 822 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  27.1 
 
 		 805 aa  52.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  26.86 
 
 		 818 aa  52  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  24.84 
 
 		 830 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  26.09 
 
 		 823 aa  47.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  21.43 
 
 		 801 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  30 
 
 		 784 aa  47  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>