42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2072 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  46.69 
 
 
818 aa  660    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  100 
 
 
784 aa  1559    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  49.41 
 
 
793 aa  648    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  53.33 
 
 
786 aa  795    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  51.71 
 
 
788 aa  718    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  46.51 
 
 
798 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  49.92 
 
 
886 aa  535  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  25.54 
 
 
839 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  23.9 
 
 
812 aa  178  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  26.39 
 
 
819 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  23.43 
 
 
809 aa  169  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  26.78 
 
 
800 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  23.38 
 
 
847 aa  167  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  24.39 
 
 
819 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  26.36 
 
 
810 aa  161  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  25.41 
 
 
821 aa  158  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  24.62 
 
 
728 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  22.85 
 
 
795 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.46 
 
 
801 aa  151  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  23.99 
 
 
805 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  22.33 
 
 
825 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  21.97 
 
 
840 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  22.39 
 
 
901 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  23.6 
 
 
830 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  30.29 
 
 
836 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  24.08 
 
 
726 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  24.01 
 
 
821 aa  104  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  24.5 
 
 
822 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  22.29 
 
 
825 aa  99  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  30.5 
 
 
809 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  26.43 
 
 
815 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  29.56 
 
 
823 aa  76.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  22.32 
 
 
856 aa  72.8  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  25.64 
 
 
801 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  24.36 
 
 
801 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  27.59 
 
 
796 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  22.64 
 
 
739 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  23.57 
 
 
883 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3982  hypothetical protein  30 
 
 
1024 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0823413  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  21.78 
 
 
736 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  32.91 
 
 
744 aa  44.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  26.27 
 
 
869 aa  44.3  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>