41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1795 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  52.05 
 
 		 809 aa  798    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 795 aa  1627    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  55.72 
 
 		 812 aa  875    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  38.09 
 
 		 801 aa  529  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  37.59 
 
 		 830 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  37.44 
 
 		 847 aa  512  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  39.13 
 
 		 825 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  37.38 
 
 		 839 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  37.71 
 
 		 901 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  35.57 
 
 		 840 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  27.65 
 
 		 836 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  24.4 
 
 		 786 aa  152  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  25.23 
 
 		 818 aa  150  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  25.35 
 
 		 788 aa  149  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  24.24 
 
 		 821 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  23.36 
 
 		 784 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  24.22 
 
 		 819 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  22.67 
 
 		 819 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  25.2 
 
 		 798 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  24.8 
 
 		 886 aa  111  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  23.59 
 
 		 805 aa  99  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  21.01 
 
 		 810 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  29.06 
 
 		 809 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  24.7 
 
 		 822 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  25.11 
 
 		 726 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  24.66 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  19.35 
 
 		 728 aa  71.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  22.39 
 
 		 793 aa  67.4  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  25.39 
 
 		 825 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  28.89 
 
 		 823 aa  65.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  23.5 
 
 		 801 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  20.3 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  24.57 
 
 		 801 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  24.31 
 
 		 821 aa  54.7  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 883 aa  52.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  23.42 
 
 		 892 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  32.76 
 
 		 962 aa  45.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  28.57 
 
 		 623 aa  45.4  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  20.48 
 
 		 856 aa  45.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  29.82 
 
 		 880 aa  44.3  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2238  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1011 aa  44.3  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>