45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7207 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  53.16 
 
 		 821 aa  818    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  90.01 
 
 		 801 aa  1334    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  100 
 
 		 801 aa  1571    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  53.79 
 
 		 823 aa  754    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  25.56 
 
 		 822 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  26.58 
 
 		 726 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  25.78 
 
 		 786 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  24.94 
 
 		 810 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  27.64 
 
 		 825 aa  94  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  23.47 
 
 		 788 aa  87.8  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  27.47 
 
 		 798 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  29.24 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  26.27 
 
 		 886 aa  74.3  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  23.64 
 
 		 728 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  23.03 
 
 		 784 aa  71.6  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  24.23 
 
 		 818 aa  70.5  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  26.51 
 
 		 744 aa  68.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  25.26 
 
 		 819 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  31.18 
 
 		 836 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  31.25 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  22.19 
 
 		 809 aa  65.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  23.5 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  37.97 
 
 		 796 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  29.26 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  28.36 
 
 		 809 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  28.83 
 
 		 840 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  26.96 
 
 		 847 aa  61.6  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  23.14 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  28.14 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  27.81 
 
 		 819 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  35.34 
 
 		 805 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  31.11 
 
 		 839 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  30.95 
 
 		 801 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 901 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  28.38 
 
 		 812 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  37.74 
 
 		 825 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2997  hypothetical protein  37.33 
 
 		 749 aa  52  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.38238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  27.27 
 
 		 892 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  21.08 
 
 		 856 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  31.25 
 
 		 894 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  23.74 
 
 		 888 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  35.38 
 
 		 962 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  25.23 
 
 		 869 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  27.27 
 
 		 880 aa  45.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1047 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>