38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1418 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  55.49 
 
 		 800 aa  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  57.73 
 
 		 819 aa  897    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  57.14 
 
 		 821 aa  883    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  60.32 
 
 		 809 aa  891    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  100 
 
 		 810 aa  1642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  41.92 
 
 		 819 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  40.61 
 
 		 805 aa  554  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  25.24 
 
 		 784 aa  144  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  27.77 
 
 		 836 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  25.31 
 
 		 788 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  26.38 
 
 		 786 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  25.33 
 
 		 818 aa  127  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  25.49 
 
 		 726 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  24.51 
 
 		 793 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  22.48 
 
 		 825 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  22.13 
 
 		 901 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  21.3 
 
 		 839 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  20.96 
 
 		 830 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.12 
 
 		 801 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  24.44 
 
 		 728 aa  105  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  21.88 
 
 		 795 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  21.92 
 
 		 856 aa  101  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  19.66 
 
 		 812 aa  97.4  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  22.02 
 
 		 840 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  24.81 
 
 		 886 aa  94.7  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  18.39 
 
 		 809 aa  94.4  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  30.39 
 
 		 815 aa  91.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  22.25 
 
 		 847 aa  90.1  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  31.98 
 
 		 822 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  25.09 
 
 		 825 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  32.32 
 
 		 801 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  27.07 
 
 		 798 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  28.41 
 
 		 821 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  29.85 
 
 		 823 aa  64.7  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  30.15 
 
 		 801 aa  65.1  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  28.87 
 
 		 962 aa  47  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  30.56 
 
 		 870 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1045 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>