34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5804 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  100 
 
 		 840 aa  1714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  42.35 
 
 		 839 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  36.41 
 
 		 801 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  35.08 
 
 		 830 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  34.01 
 
 		 812 aa  469  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  34.44 
 
 		 809 aa  465  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  35.58 
 
 		 795 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  33.57 
 
 		 825 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  32.93 
 
 		 847 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  33.1 
 
 		 901 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  26.28 
 
 		 786 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  29.29 
 
 		 836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  23.61 
 
 		 819 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  27.27 
 
 		 798 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  23.19 
 
 		 800 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  23.2 
 
 		 805 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  22.11 
 
 		 784 aa  106  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  21.25 
 
 		 810 aa  93.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  24.1 
 
 		 818 aa  90.9  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  25.45 
 
 		 788 aa  90.5  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  27.05 
 
 		 886 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  24.66 
 
 		 793 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  24.63 
 
 		 809 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  30.19 
 
 		 825 aa  74.7  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  30.86 
 
 		 815 aa  70.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  24.26 
 
 		 821 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  27.04 
 
 		 822 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  27.4 
 
 		 819 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  28.83 
 
 		 801 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  31.94 
 
 		 823 aa  58.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  20.93 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  23.89 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  20.41 
 
 		 728 aa  49.3  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  26.26 
 
 		 870 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>