38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3503 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  43.71 
 
 
819 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  57.73 
 
 
810 aa  876    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  61.87 
 
 
809 aa  914    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  100 
 
 
819 aa  1655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  89.52 
 
 
821 aa  1395    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  56.12 
 
 
800 aa  838    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  41.51 
 
 
805 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  24.68 
 
 
901 aa  151  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  24.1 
 
 
784 aa  144  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  24.53 
 
 
795 aa  142  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  23.33 
 
 
839 aa  141  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  22.02 
 
 
809 aa  131  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  22.94 
 
 
830 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  23.76 
 
 
786 aa  127  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  23.02 
 
 
825 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  23.23 
 
 
818 aa  124  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  23.56 
 
 
788 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  24.55 
 
 
886 aa  121  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  24.02 
 
 
801 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  24.22 
 
 
726 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  24.19 
 
 
840 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  23.55 
 
 
847 aa  102  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  20.76 
 
 
812 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  24.37 
 
 
798 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  19.7 
 
 
728 aa  97.8  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  21.51 
 
 
856 aa  92.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  28.62 
 
 
836 aa  90.9  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  27.61 
 
 
793 aa  90.1  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  30.77 
 
 
815 aa  80.9  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  27.78 
 
 
825 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  26.99 
 
 
822 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  27.59 
 
 
823 aa  61.6  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  27.81 
 
 
801 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  30.3 
 
 
801 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  35.62 
 
 
821 aa  56.6  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  30.21 
 
 
892 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  24.11 
 
 
1047 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  35.23 
 
 
1140 aa  45.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>