38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2277 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  69.37 
 
 		 788 aa  825    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  100 
 
 		 886 aa  1773    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  54.78 
 
 		 818 aa  627  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  49.84 
 
 		 786 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  49.59 
 
 		 784 aa  529  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  50.24 
 
 		 793 aa  524  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  50.25 
 
 		 798 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  24.68 
 
 		 825 aa  151  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  25.08 
 
 		 812 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  25.39 
 
 		 830 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  26.66 
 
 		 800 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  24.96 
 
 		 839 aa  141  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  21.05 
 
 		 809 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  25.04 
 
 		 819 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  25.19 
 
 		 819 aa  137  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.62 
 
 		 801 aa  134  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  25.39 
 
 		 805 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  24.02 
 
 		 795 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  23.24 
 
 		 728 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  22.65 
 
 		 847 aa  125  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  23.15 
 
 		 840 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  23.69 
 
 		 809 aa  121  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  24.64 
 
 		 901 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  38 
 
 		 836 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  25.11 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  24.66 
 
 		 726 aa  94.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  23.99 
 
 		 825 aa  93.2  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  25.08 
 
 		 821 aa  84  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  23.78 
 
 		 822 aa  81.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  24.06 
 
 		 823 aa  74.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  29.87 
 
 		 801 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  29.18 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1500  hypothetical protein  68.42 
 
 		 60 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  22.22 
 
 		 821 aa  62  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  24.51 
 
 		 796 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  24.72 
 
 		 815 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  25.68 
 
 		 856 aa  48.5  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  34.23 
 
 		 869 aa  47  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>