39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2437 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  52.13 
 
 
793 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  50.26 
 
 
798 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  55.96 
 
 
818 aa  812    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  51.35 
 
 
784 aa  711    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  50.71 
 
 
786 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  100 
 
 
788 aa  1574    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  69.87 
 
 
886 aa  808    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  28.82 
 
 
836 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  26.36 
 
 
795 aa  167  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.3 
 
 
801 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  23.52 
 
 
809 aa  165  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  22.99 
 
 
825 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  23.58 
 
 
839 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  24.6 
 
 
812 aa  161  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  26.4 
 
 
805 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  23.84 
 
 
847 aa  159  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  25.47 
 
 
800 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  24.97 
 
 
819 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  24.34 
 
 
901 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  24.33 
 
 
830 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  25.53 
 
 
810 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  23.23 
 
 
728 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  23.18 
 
 
819 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  22.82 
 
 
821 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  24.02 
 
 
821 aa  117  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  26.37 
 
 
822 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  24.83 
 
 
823 aa  111  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  25.17 
 
 
726 aa  101  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  25.82 
 
 
840 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  24.4 
 
 
815 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  21.69 
 
 
825 aa  93.6  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  24.28 
 
 
856 aa  72.4  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  24.81 
 
 
809 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  26.51 
 
 
801 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  27.38 
 
 
801 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  24.06 
 
 
869 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1500  hypothetical protein  67.31 
 
 
60 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  22.34 
 
 
736 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2238  hypothetical protein  24.55 
 
 
1011 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>