40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2176 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 728 aa  1458    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  22 
 
 		 819 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  22.99 
 
 		 805 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  24.25 
 
 		 786 aa  138  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  24.79 
 
 		 784 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  22.75 
 
 		 822 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  22.8 
 
 		 821 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  22.66 
 
 		 726 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  22.59 
 
 		 788 aa  114  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  22.68 
 
 		 825 aa  107  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  23.59 
 
 		 886 aa  103  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  26.7 
 
 		 823 aa  101  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  24.2 
 
 		 800 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  23.25 
 
 		 810 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  26.12 
 
 		 815 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  25.82 
 
 		 818 aa  87.8  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  23.57 
 
 		 809 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  22.98 
 
 		 821 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  25.94 
 
 		 744 aa  80.9  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  21.98 
 
 		 809 aa  79.7  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  24.51 
 
 		 856 aa  79  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  24.5 
 
 		 793 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  24.16 
 
 		 801 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  22.28 
 
 		 819 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  24.18 
 
 		 801 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  20.08 
 
 		 825 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  19.57 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  19.91 
 
 		 812 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  19.35 
 
 		 847 aa  67.8  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  18.99 
 
 		 830 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  24.31 
 
 		 798 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  23.93 
 
 		 836 aa  61.2  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  19.38 
 
 		 839 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2997  hypothetical protein  25.37 
 
 		 749 aa  58.9  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.38238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  20.11 
 
 		 801 aa  57.4  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  21.82 
 
 		 901 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2238  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  23.91 
 
 		 869 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  20.34 
 
 		 840 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  27.08 
 
 		 870 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>