47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0232 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  100 
 
 
825 aa  1670    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  24.07 
 
 
726 aa  120  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  29.39 
 
 
786 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  22.68 
 
 
728 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  29.96 
 
 
815 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  27.27 
 
 
801 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  26.25 
 
 
784 aa  92  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  22.97 
 
 
886 aa  90.9  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  26.38 
 
 
788 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  26.48 
 
 
801 aa  89  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  28.92 
 
 
822 aa  87.8  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  33.88 
 
 
836 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  25.09 
 
 
810 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  26.54 
 
 
809 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  23.63 
 
 
821 aa  81.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  27.78 
 
 
819 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  25.44 
 
 
798 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  22.28 
 
 
818 aa  79  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  26.26 
 
 
793 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  25.65 
 
 
823 aa  78.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  30.19 
 
 
840 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  24.78 
 
 
805 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  26.61 
 
 
901 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  23.58 
 
 
800 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  26.89 
 
 
821 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  34.88 
 
 
847 aa  67.4  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  25.39 
 
 
795 aa  66.2  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  25.79 
 
 
830 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  26.23 
 
 
825 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  21.32 
 
 
819 aa  64.3  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  26.04 
 
 
839 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2466  hypothetical protein  35.96 
 
 
940 aa  61.6  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  27.92 
 
 
812 aa  61.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  31.11 
 
 
809 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  35.94 
 
 
796 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  38.36 
 
 
801 aa  58.9  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  25.09 
 
 
744 aa  57.8  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  28.26 
 
 
1047 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  32.89 
 
 
870 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3982  hypothetical protein  23.68 
 
 
1024 aa  51.2  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0823413  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2156  integral membrane protein-like protein  29.13 
 
 
791 aa  50.8  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  28.26 
 
 
869 aa  47.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  30.14 
 
 
883 aa  47  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4293  hypothetical protein  26.26 
 
 
778 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.362363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  29.29 
 
 
892 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  31.65 
 
 
1045 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1023  hypothetical protein  27.64 
 
 
847 aa  45.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.546807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>