19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7627 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  100 
 
 
1045 aa  2049    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  52.29 
 
 
1047 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  26.02 
 
 
744 aa  69.7  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  27.36 
 
 
822 aa  62  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  27.23 
 
 
815 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  26.45 
 
 
793 aa  53.9  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  27.69 
 
 
810 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  30.3 
 
 
809 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14370  membrane protein YfhO  43.94 
 
 
957 aa  48.9  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  25.83 
 
 
821 aa  48.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  31.03 
 
 
726 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  27.81 
 
 
821 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  25.58 
 
 
892 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  31.65 
 
 
825 aa  46.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  38.1 
 
 
836 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  28.51 
 
 
869 aa  45.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  25.22 
 
 
819 aa  45.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  28.36 
 
 
894 aa  44.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4008  hypothetical protein  30.21 
 
 
777 aa  45.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266217  normal  0.528779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>