42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0571 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  100 
 
 		 836 aa  1655    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  30.83 
 
 		 830 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  27.8 
 
 		 825 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  29.53 
 
 		 847 aa  312  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  28.94 
 
 		 839 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  27.22 
 
 		 809 aa  298  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  28.22 
 
 		 795 aa  289  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  28.46 
 
 		 840 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  27.87 
 
 		 901 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  25.64 
 
 		 812 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  26.67 
 
 		 801 aa  268  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  27.35 
 
 		 786 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  28.11 
 
 		 788 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  27.33 
 
 		 819 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  26.55 
 
 		 798 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  29.65 
 
 		 886 aa  164  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  26.06 
 
 		 805 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  28.08 
 
 		 784 aa  161  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  27.15 
 
 		 800 aa  155  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  27.9 
 
 		 810 aa  150  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  26.63 
 
 		 819 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  32.85 
 
 		 818 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  27.57 
 
 		 726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  30.93 
 
 		 793 aa  111  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  27.8 
 
 		 822 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  28.68 
 
 		 821 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  28.39 
 
 		 809 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  20.18 
 
 		 728 aa  97.8  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  24.96 
 
 		 823 aa  89  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  33.82 
 
 		 825 aa  87.8  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  28.63 
 
 		 815 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  31.86 
 
 		 801 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  45.16 
 
 		 796 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  34.07 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1047 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  28.98 
 
 		 856 aa  58.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1045 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  27.18 
 
 		 962 aa  48.9  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  27.62 
 
 		 869 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  26.78 
 
 		 870 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  28.95 
 
 		 883 aa  45.8  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2997  hypothetical protein  33.73 
 
 		 749 aa  45.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.38238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>