17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0394 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  100 
 
 
744 aa  1492    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  28.92 
 
 
822 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  25.94 
 
 
728 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  27.33 
 
 
726 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  25.09 
 
 
825 aa  57.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  25.67 
 
 
1045 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  27.9 
 
 
815 aa  54.7  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  26.45 
 
 
1047 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  25.9 
 
 
823 aa  52.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  26.2 
 
 
801 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  26.23 
 
 
801 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  24.17 
 
 
821 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  26.4 
 
 
786 aa  47.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  25.83 
 
 
793 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  27.67 
 
 
818 aa  44.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  32.91 
 
 
784 aa  44.3  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  21.36 
 
 
856 aa  44.3  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>