27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2073 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  100 
 
 		 1047 aa  2055    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  42.24 
 
 		 1045 aa  628  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  28.71 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  26.25 
 
 		 822 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  28.57 
 
 		 809 aa  64.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  25.07 
 
 		 744 aa  60.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  34.51 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  28.26 
 
 		 825 aa  55.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  29.13 
 
 		 869 aa  55.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  26.86 
 
 		 796 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  25.83 
 
 		 726 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  25.57 
 
 		 821 aa  49.7  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  26.35 
 
 		 805 aa  48.5  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  25.36 
 
 		 793 aa  48.1  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  34.07 
 
 		 964 aa  48.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 821 aa  47.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  25.21 
 
 		 830 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  29.67 
 
 		 962 aa  47.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  28.31 
 
 		 819 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  28.09 
 
 		 798 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  26.59 
 
 		 786 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  25.35 
 
 		 823 aa  45.8  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  23.98 
 
 		 819 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  27.84 
 
 		 901 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  28.57 
 
 		 801 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  34.62 
 
 		 801 aa  44.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  24.56 
 
 		 883 aa  45.1  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>