42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3775 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  45.68 
 
 		 819 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  60.32 
 
 		 810 aa  900    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  61.87 
 
 		 819 aa  954    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  61.37 
 
 		 821 aa  951    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  61.08 
 
 		 800 aa  901    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  40.81 
 
 		 805 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  25.2 
 
 		 795 aa  140  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  22.74 
 
 		 839 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  24.76 
 
 		 784 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  23.39 
 
 		 901 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  24.42 
 
 		 726 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  21.83 
 
 		 809 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  24.06 
 
 		 818 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  25.52 
 
 		 788 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.15 
 
 		 801 aa  118  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  24.31 
 
 		 825 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  20.47 
 
 		 728 aa  111  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  24.17 
 
 		 840 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  25.38 
 
 		 786 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  21.3 
 
 		 830 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  21.99 
 
 		 812 aa  108  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  24.7 
 
 		 798 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  24.49 
 
 		 886 aa  106  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  24.19 
 
 		 847 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  28.42 
 
 		 815 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  28.31 
 
 		 793 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  29.44 
 
 		 822 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  26.54 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  28.47 
 
 		 836 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  26.69 
 
 		 856 aa  73.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  28.36 
 
 		 801 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  26.47 
 
 		 801 aa  62  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1047 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  24.86 
 
 		 823 aa  61.2  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  28.1 
 
 		 821 aa  57.4  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  25 
 
 		 796 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  29.11 
 
 		 892 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1045 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  35.29 
 
 		 1140 aa  45.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  28.17 
 
 		 888 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  27.14 
 
 		 894 aa  44.3  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>