18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2298 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  100 
 
 
869 aa  1746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2997  hypothetical protein  36.86 
 
 
749 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.38238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2238  hypothetical protein  22.96 
 
 
1011 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16000  hypothetical protein  34.51 
 
 
731 aa  65.1  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0163301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  31.05 
 
 
822 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  33.61 
 
 
788 aa  55.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  29.13 
 
 
1047 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  26.17 
 
 
726 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  29.57 
 
 
801 aa  51.2  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  31.9 
 
 
818 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  26.04 
 
 
796 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  28.26 
 
 
825 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  26.13 
 
 
801 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  28.5 
 
 
870 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  25.23 
 
 
801 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  32.76 
 
 
793 aa  45.8  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  28.99 
 
 
823 aa  45.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  29.17 
 
 
728 aa  44.3  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>