13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2238 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2238  hypothetical protein  100 
 
 
1011 aa  2016    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  22.96 
 
 
869 aa  77  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  25.45 
 
 
822 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2997  hypothetical protein  26.95 
 
 
749 aa  64.7  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.38238 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  27.71 
 
 
728 aa  55.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  31.75 
 
 
815 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  28.92 
 
 
744 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  29.9 
 
 
1045 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  24.55 
 
 
788 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  28.57 
 
 
798 aa  45.8  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
962 aa  45.4  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  26.96 
 
 
1047 aa  45.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 
478 aa  44.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>