46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1857 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  58.68 
 
 		 818 aa  910    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  49.94 
 
 		 793 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 798 aa  1593    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  47.18 
 
 		 786 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  50.72 
 
 		 788 aa  730    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  46.52 
 
 		 784 aa  631  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  50.84 
 
 		 886 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  24.75 
 
 		 809 aa  187  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  24.13 
 
 		 812 aa  187  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  24.61 
 
 		 847 aa  185  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  25.67 
 
 		 830 aa  184  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  25.99 
 
 		 839 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  24.85 
 
 		 840 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  24.67 
 
 		 825 aa  177  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  26.27 
 
 		 800 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  24.04 
 
 		 901 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  24.07 
 
 		 795 aa  161  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  24.76 
 
 		 819 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  26.07 
 
 		 805 aa  154  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.18 
 
 		 801 aa  154  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  25.33 
 
 		 809 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  25.09 
 
 		 821 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  26.28 
 
 		 810 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  23.63 
 
 		 728 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  25.33 
 
 		 819 aa  137  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  25.38 
 
 		 822 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  31.47 
 
 		 836 aa  127  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  23.78 
 
 		 823 aa  120  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  26.77 
 
 		 815 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  24.05 
 
 		 821 aa  109  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  24.83 
 
 		 726 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  23.8 
 
 		 825 aa  95.5  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  29.18 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  27.47 
 
 		 801 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  25.88 
 
 		 856 aa  75.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  26.3 
 
 		 869 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3982  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1024 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0823413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  24.52 
 
 		 892 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  25.76 
 
 		 894 aa  50.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  27.1 
 
 		 712 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  23.12 
 
 		 888 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  22.78 
 
 		 870 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1047 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  26.55 
 
 		 962 aa  46.2  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2238  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1011 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  23.98 
 
 		 796 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>