26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0893 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  43.58 
 
 		 859 aa  658    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 883 aa  1787    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  38.42 
 
 		 623 aa  392  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  25.54 
 
 		 871 aa  195  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  22.21 
 
 		 964 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  25.36 
 
 		 869 aa  178  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  24.54 
 
 		 859 aa  160  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  23.49 
 
 		 880 aa  152  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  25.24 
 
 		 903 aa  151  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  21.28 
 
 		 892 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  20.1 
 
 		 962 aa  91.7  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  26.03 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  19.09 
 
 		 894 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14370  membrane protein YfhO  21 
 
 		 957 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  20.62 
 
 		 888 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 795 aa  52  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  24.68 
 
 		 821 aa  51.2  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  37.97 
 
 		 901 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2997  hypothetical protein  25.44 
 
 		 749 aa  49.3  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.38238 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  23.57 
 
 		 784 aa  48.9  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  32.86 
 
 		 839 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  42 
 
 		 847 aa  48.5  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  30.14 
 
 		 825 aa  47  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  32.91 
 
 		 825 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  24.77 
 
 		 823 aa  46.2  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  34.52 
 
 		 812 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>