39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2022 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  100 
 
 
847 aa  1736    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  37.33 
 
 
809 aa  510  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  36.55 
 
 
801 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  37.38 
 
 
795 aa  496  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  36.45 
 
 
830 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  36.65 
 
 
812 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  36.43 
 
 
825 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  35.3 
 
 
901 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  36.72 
 
 
839 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  33.13 
 
 
840 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  28.79 
 
 
836 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  23.3 
 
 
786 aa  145  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  23.78 
 
 
819 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  23.8 
 
 
818 aa  127  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  22.72 
 
 
805 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  22.43 
 
 
788 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  23.93 
 
 
784 aa  105  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  25.09 
 
 
798 aa  96.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  22.37 
 
 
800 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  23.46 
 
 
886 aa  95.1  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  23.3 
 
 
819 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  23.8 
 
 
809 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  21.46 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  34.88 
 
 
825 aa  67.8  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  33.33 
 
 
823 aa  65.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  24.58 
 
 
726 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  23.98 
 
 
815 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  27.27 
 
 
801 aa  62  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  22.02 
 
 
793 aa  62  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  45.16 
 
 
801 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  19.11 
 
 
728 aa  59.3  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  26.95 
 
 
821 aa  58.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  22.74 
 
 
821 aa  54.7  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  31.52 
 
 
822 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  28.91 
 
 
883 aa  53.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  38.33 
 
 
796 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  27.64 
 
 
870 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  30.77 
 
 
623 aa  46.2  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  26.92 
 
 
856 aa  45.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>