41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0636 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  100 
 
 		 800 aa  1623    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  55.8 
 
 		 821 aa  844    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  44.18 
 
 		 819 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  56.12 
 
 		 819 aa  852    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  61.42 
 
 		 809 aa  873    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  55.6 
 
 		 810 aa  841    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  40.62 
 
 		 805 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  26.22 
 
 		 784 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  25.03 
 
 		 788 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  23.62 
 
 		 818 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  25.48 
 
 		 786 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  26.6 
 
 		 886 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  21.49 
 
 		 856 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  22.57 
 
 		 825 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.36 
 
 		 801 aa  125  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  23.51 
 
 		 840 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  21.78 
 
 		 839 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  22.18 
 
 		 728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  25.4 
 
 		 798 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  21.06 
 
 		 901 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  21.06 
 
 		 830 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  33.66 
 
 		 726 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  20 
 
 		 809 aa  99  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  23.3 
 
 		 847 aa  98.2  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  22.97 
 
 		 823 aa  97.4  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  18.68 
 
 		 812 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  30.69 
 
 		 836 aa  91.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  22.76 
 
 		 821 aa  89.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  29.68 
 
 		 822 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  29.28 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  23.58 
 
 		 825 aa  72.4  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  32.64 
 
 		 801 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  26.89 
 
 		 793 aa  68.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  31.94 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  22.35 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  32.65 
 
 		 892 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  30.95 
 
 		 796 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  30.84 
 
 		 871 aa  48.9  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  31.43 
 
 		 888 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  28.38 
 
 		 903 aa  48.1  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  31.43 
 
 		 894 aa  44.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>