35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2877 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  57.13 
 
 		 805 aa  895    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  43.71 
 
 		 819 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  45.69 
 
 		 809 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  41.92 
 
 		 821 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  42.23 
 
 		 810 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  43.94 
 
 		 800 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  22.76 
 
 		 825 aa  144  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  25.75 
 
 		 784 aa  143  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  24.93 
 
 		 726 aa  142  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  23.86 
 
 		 830 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  22 
 
 		 728 aa  131  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  21.61 
 
 		 809 aa  130  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  23.61 
 
 		 840 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  24.9 
 
 		 788 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  22.95 
 
 		 786 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  23.64 
 
 		 847 aa  126  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  23.01 
 
 		 818 aa  125  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  23.64 
 
 		 901 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.12 
 
 		 801 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  23.51 
 
 		 822 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  25.9 
 
 		 886 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  23.03 
 
 		 839 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  22.3 
 
 		 812 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  22.64 
 
 		 795 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  28.77 
 
 		 836 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  26.42 
 
 		 793 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  24.89 
 
 		 815 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  23.72 
 
 		 856 aa  78.2  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  21.32 
 
 		 825 aa  64.3  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  27.04 
 
 		 798 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  37.5 
 
 		 801 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  40.91 
 
 		 801 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  24.65 
 
 		 823 aa  54.3  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  31.76 
 
 		 821 aa  45.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>