21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12000 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  100 
 
 		 1140 aa  2354    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  27.73 
 
 		 892 aa  196  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  31.01 
 
 		 888 aa  182  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  31.23 
 
 		 894 aa  177  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0809  hypothetical protein  25.19 
 
 		 866 aa  92  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00005758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1326  hypothetical protein  25.06 
 
 		 868 aa  82.4  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0986075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1301  membrane protein-like protein  25.06 
 
 		 868 aa  82.4  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000816869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  24.94 
 
 		 962 aa  80.5  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  26.79 
 
 		 880 aa  67.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  28.09 
 
 		 903 aa  60.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14370  membrane protein YfhO  25.69 
 
 		 957 aa  58.9  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1829  glycosyltransferase  25.45 
 
 		 937 aa  58.2  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  32.99 
 
 		 964 aa  58.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  23.87 
 
 		 869 aa  57.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  26.3 
 
 		 933 aa  52.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  32.22 
 
 		 805 aa  50.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  43.4 
 
 		 815 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  23.85 
 
 		 871 aa  47.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  35.23 
 
 		 819 aa  45.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  33.33 
 
 		 809 aa  45.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  31.51 
 
 		 798 aa  45.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>