89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0813 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0813  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  337  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  82.11 
 
 		 365 aa  200  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  65.38 
 
 		 374 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  39.83 
 
 		 390 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  39.32 
 
 		 364 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  40 
 
 		 370 aa  89  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  49.11 
 
 		 375 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 		 370 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  35.59 
 
 		 369 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  40 
 
 		 370 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  40 
 
 		 370 aa  88.6  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  40 
 
 		 370 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  40 
 
 		 370 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  40 
 
 		 370 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  40 
 
 		 370 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  40 
 
 		 370 aa  87.8  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  36.44 
 
 		 395 aa  87.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  40.35 
 
 		 371 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  35.09 
 
 		 367 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  35.09 
 
 		 365 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  35.09 
 
 		 367 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  36.17 
 
 		 366 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  32.77 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  42.11 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  42.11 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  42.11 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  42.11 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  42.11 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  30.85 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  31.63 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  29.9 
 
 		 355 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  32.98 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  25.51 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  34.72 
 
 		 352 aa  54.3  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  26.53 
 
 		 348 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  26.53 
 
 		 349 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  25.53 
 
 		 350 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  25.26 
 
 		 361 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  25.53 
 
 		 349 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  25.53 
 
 		 350 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  32.38 
 
 		 406 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  32.38 
 
 		 406 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  32.2 
 
 		 365 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  34.45 
 
 		 367 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  24.81 
 
 		 368 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0752  hypothetical protein  35.59 
 
 		 365 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0379564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  31.18 
 
 		 372 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  31.43 
 
 		 398 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  26.83 
 
 		 381 aa  47.8  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  30.17 
 
 		 371 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  25.95 
 
 		 362 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  28.87 
 
 		 391 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0714  permease  33.9 
 
 		 365 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0333328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  30.48 
 
 		 354 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  29.86 
 
 		 369 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  31.07 
 
 		 369 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  29.03 
 
 		 356 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  29.03 
 
 		 356 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  29.31 
 
 		 371 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  29.37 
 
 		 360 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  24.04 
 
 		 370 aa  45.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  27.72 
 
 		 376 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 		 363 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  32.91 
 
 		 362 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  27.96 
 
 		 380 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  29.17 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  22.81 
 
 		 383 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  46.34 
 
 		 361 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 		 358 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  27.78 
 
 		 360 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  27.78 
 
 		 360 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  27.78 
 
 		 359 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 356 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  23.68 
 
 		 356 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  24.79 
 
 		 367 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  26.67 
 
 		 379 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  24.35 
 
 		 377 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 363 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 363 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>