More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2552 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2552  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
281 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.309894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0332  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.36 
 
 
278 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
257 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
263 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
280 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
269 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
266 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
261 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
266 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  36.24 
 
 
261 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
266 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
271 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.86 
 
 
282 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
265 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
263 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 
263 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 
265 aa  122  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.5 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
263 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
265 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.79 
 
 
262 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
261 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30.23 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 
267 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
266 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  27.09 
 
 
261 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  35.1 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
261 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
278 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
259 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
263 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
255 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
263 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.89 
 
 
260 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 
270 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
282 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
264 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
267 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
271 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
260 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.76 
 
 
260 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
262 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
265 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.24 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4163  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.941221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.35 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
256 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  29.6 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
263 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
270 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
262 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.03 
 
 
272 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
264 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  28.96 
 
 
266 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  34.53 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
262 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.16 
 
 
264 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  29.12 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>