More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2020 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2020  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
257 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  64.45 
 
 
257 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  32.94 
 
 
259 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  36.61 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  40.16 
 
 
255 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  38.22 
 
 
253 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  34.8 
 
 
257 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  36.77 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  36.19 
 
 
261 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  34.33 
 
 
254 aa  142  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  32.88 
 
 
265 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  36.63 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  36.89 
 
 
260 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  35.04 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  38.35 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  35.53 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  30.36 
 
 
260 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 
261 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  34.74 
 
 
253 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
264 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  32.89 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  33.86 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  29.67 
 
 
255 aa  118  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  31.1 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  31.94 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  36.32 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  31.98 
 
 
261 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 
257 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  31.42 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  30.59 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  30.59 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  32.75 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  35.75 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  33.06 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  30.59 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  33.04 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  33.06 
 
 
261 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  33.49 
 
 
265 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.16 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  33.92 
 
 
259 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  32.84 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  34.7 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.17 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  34.5 
 
 
254 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.11 
 
 
261 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  32.93 
 
 
256 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  32.31 
 
 
253 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  35.02 
 
 
258 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  37.44 
 
 
239 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  35.37 
 
 
264 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 
253 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32.35 
 
 
256 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  32.35 
 
 
247 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  30.53 
 
 
261 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  32.68 
 
 
257 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 
240 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  33.98 
 
 
264 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  27.41 
 
 
267 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  35.29 
 
 
263 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  33.65 
 
 
269 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  26.56 
 
 
261 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  33.65 
 
 
269 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.83 
 
 
267 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  33.5 
 
 
261 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.28 
 
 
261 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  26.74 
 
 
258 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  29.55 
 
 
260 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  31.86 
 
 
262 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  32.06 
 
 
256 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 
256 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  27.9 
 
 
267 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  30.16 
 
 
257 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  29.75 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.39 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  32.41 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.83 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  32.02 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  34.16 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  26.98 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  34.73 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  30.43 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  30.23 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  28.69 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  28.69 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  29.95 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  29.95 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  29.95 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  29.95 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  29.82 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  28.11 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  37.44 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  27.65 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  33.64 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  31.68 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>