More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2758 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2758  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 1010 aa  2060    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2658  PDZ/DHR/GLGF:ankyrin  71.85 
 
 		 1003 aa  1468    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1585 aa  83.2  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  31.44 
 
 		 870 aa  80.1  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  28.11 
 
 		 1156 aa  76.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  29.17 
 
 		 762 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  30.77 
 
 		 723 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  33.15 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  30.3 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  30 
 
 		 855 aa  65.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  28 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  31.36 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 1030 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  25.09 
 
 		 715 aa  63.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  27.69 
 
 		 731 aa  62.4  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 1021 aa  62  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  26.54 
 
 		 640 aa  60.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  23.6 
 
 		 404 aa  60.1  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24.24 
 
 		 2413 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2700  hypothetical protein  32.35 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.57882  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  31.34 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  27.82 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 		 1622 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  29.35 
 
 		 931 aa  57.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.27 
 
 		 464 aa  57.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.24 
 
 		 502 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  45.59 
 
 		 597 aa  56.2  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.03 
 
 		 412 aa  55.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  22.88 
 
 		 2171 aa  55.8  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  27.27 
 
 		 494 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  29.31 
 
 		 296 aa  55.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  26.86 
 
 		 1061 aa  55.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  40.35 
 
 		 387 aa  55.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  40.35 
 
 		 402 aa  55.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  40.35 
 
 		 388 aa  55.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  28.16 
 
 		 490 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  40.35 
 
 		 402 aa  55.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  40.35 
 
 		 402 aa  55.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  40.35 
 
 		 402 aa  55.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  29.41 
 
 		 756 aa  54.7  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  30.2 
 
 		 450 aa  54.7  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0687  hypothetical protein  31.61 
 
 		 902 aa  54.3  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0035  ankyrin repeat-containing protein  28.09 
 
 		 288 aa  54.3  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  24.9 
 
 		 954 aa  54.3  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2481  Ankyrin  23.83 
 
 		 391 aa  54.3  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000229526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  40.35 
 
 		 402 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  40.35 
 
 		 401 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  28.19 
 
 		 337 aa  54.3  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  31.36 
 
 		 194 aa  54.3  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 		 401 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  26.5 
 
 		 790 aa  53.9  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 		 401 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 		 401 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  44.83 
 
 		 485 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  28.51 
 
 		 865 aa  53.5  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  39.44 
 
 		 504 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.83 
 
 		 579 aa  53.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  25 
 
 		 483 aa  53.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  37.14 
 
 		 462 aa  53.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  28.57 
 
 		 140 aa  53.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  32.46 
 
 		 144 aa  53.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  41.51 
 
 		 388 aa  53.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  37.5 
 
 		 474 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  37.14 
 
 		 461 aa  53.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  34.34 
 
 		 500 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  35.09 
 
 		 173 aa  52.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  39.66 
 
 		 545 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40 
 
 		 504 aa  53.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.03 
 
 		 453 aa  52.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  26.59 
 
 		 581 aa  52.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  29.57 
 
 		 467 aa  52  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0448  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.54 
 
 		 347 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08999  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 		 740 aa  52  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.7 
 
 		 388 aa  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  38.03 
 
 		 503 aa  52  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  36.62 
 
 		 407 aa  52  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  30.77 
 
 		 472 aa  51.6  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  29.46 
 
 		 162 aa  51.6  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  30.48 
 
 		 157 aa  51.6  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  28.43 
 
 		 473 aa  51.6  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  26.82 
 
 		 516 aa  51.2  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  26.67 
 
 		 236 aa  51.2  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2699  Ankyrin  27.31 
 
 		 360 aa  50.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6935  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  29.41 
 
 		 584 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  36.62 
 
 		 396 aa  50.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  30.39 
 
 		 545 aa  50.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  36.62 
 
 		 407 aa  50.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  43.86 
 
 		 407 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  38.6 
 
 		 401 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.6 
 
 		 401 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05168  NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07030)  25.68 
 
 		 1307 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6235  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 1133 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  34.94 
 
 		 383 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  43.86 
 
 		 514 aa  50.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.76 
 
 		 482 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1005 aa  50.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  26.79 
 
 		 427 aa  50.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  38.6 
 
 		 403 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  35.37 
 
 		 520 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  27.27 
 
 		 711 aa  50.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>