190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2149 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2149  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1080  hypothetical protein  27.7 
 
 
417 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  30.49 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
367 aa  63.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
370 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02925  putative glycosyltransferase  22.81 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  26.42 
 
 
452 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  31.31 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  22.13 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
575 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
810 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  26.51 
 
 
389 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.57 
 
 
371 aa  56.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5225  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
402 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
368 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  35.4 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
704 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
389 aa  53.5  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
386 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
385 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
412 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  27.63 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.59 
 
 
385 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1122  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
342 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  20.5 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
409 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
364 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
340 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
399 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
388 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
392 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
363 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.59 
 
 
419 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
374 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  27.27 
 
 
564 aa  49.7  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
367 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
397 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4251  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.170492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  30.86 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
424 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.32 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
464 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>