173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0564 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0564  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 114 aa  225  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0466  ribosome-binding factor A  85.22 
 
 		 115 aa  197  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1317  ribosomal binding factor A  39.53 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  27.36 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  28.95 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  29.2 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  28.95 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  29.25 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  28.83 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  28.3 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  26.42 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  31.63 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  30.19 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  28.3 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  27.1 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  26.42 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  27.78 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  27.78 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  28.04 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  26.85 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  26.85 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  27.93 
 
 		 145 aa  50.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  27.52 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  28.83 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  27.36 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  22.77 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0955  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.676636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0115  ribosome-binding factor A  24.77 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  28.04 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  29.81 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  27.68 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  30.84 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  28.42 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  27.1 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  27.27 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  25.89 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  25.44 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  28.83 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  26.92 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  28.07 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  24.75 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  27.96 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  28.04 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  27.1 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  27.88 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  26.85 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  24.76 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  26.17 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  27.62 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  30.38 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  30.26 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  32.89 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  30.38 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  30.38 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  30.38 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  26.32 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  27.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  30.11 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  26.42 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0403  ribosome-binding factor A  25.96 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000114311  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0860  ribosome-binding factor A  29.17 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1498  ribosome-binding factor A  27.27 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  26.17 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  26.17 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  24.53 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  24.53 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0301  ribosome-binding factor A  25.23 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000015742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>