38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1317 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1317  ribosomal binding factor A  100 
 
 		 132 aa  268  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0564  ribosome-binding factor A  39.53 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0466  ribosome-binding factor A  40.62 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  27.48 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  22.9 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  22.9 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  24.22 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  25.19 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  23.66 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  23.08 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  23.66 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  23.66 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  23.44 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  24.6 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  24.6 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  27.42 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  23.44 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  22.31 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  22.66 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  21.8 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  19.23 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  22.9 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  23.08 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  21.43 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  23.08 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  23.44 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  25.76 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01291  ribosome-binding factor A  26.61 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.774457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  22.48 
 
 		 135 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  25.2 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  22.9 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  22.9 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  22.9 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  26.52 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  21.88 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  23.44 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  23.62 
 
 		 122 aa  40  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>