More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0013 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0013  putative pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.78311  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0941  pyrroline-5-carboxylate reductase  83.4 
 
 
268 aa  434  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 
273 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.45 
 
 
280 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.3 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.3 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.42 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.81 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.89 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.4 
 
 
281 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.12 
 
 
293 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.75 
 
 
281 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.84 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.46 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.81 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.17 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.28 
 
 
300 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.57 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.63 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.22 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.12 
 
 
301 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.41 
 
 
273 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.31 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.72 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.76 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.76 
 
 
273 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.98 
 
 
275 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.1 
 
 
273 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.93 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  28.36 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  28.84 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.61 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.82 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.51 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  28.46 
 
 
262 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.74 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.26 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.92 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.93 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.53 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 
273 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.27 
 
 
277 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.41 
 
 
282 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.89 
 
 
277 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.82 
 
 
282 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.1 
 
 
271 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  27 
 
 
273 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.37 
 
 
280 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.42 
 
 
268 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.45 
 
 
270 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.94 
 
 
272 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
267 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 
275 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 
275 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.61 
 
 
267 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.59 
 
 
267 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.03 
 
 
273 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.1 
 
 
277 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1383  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.57 
 
 
263 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.9 
 
 
272 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.1 
 
 
273 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.64 
 
 
269 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.28 
 
 
274 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.17 
 
 
275 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.82 
 
 
279 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.74 
 
 
279 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.82 
 
 
279 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.2 
 
 
279 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.09 
 
 
274 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.27 
 
 
273 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.59 
 
 
275 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.58 
 
 
280 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.24 
 
 
267 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.56 
 
 
273 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.2 
 
 
279 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
284 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.28 
 
 
274 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.48 
 
 
277 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.82 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.54 
 
 
272 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.82 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.82 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.2 
 
 
289 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.22 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.2 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.62 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.4 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.83 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.21 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.72 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.4 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.43 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1065  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.37 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.378355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.05 
 
 
269 aa  95.9  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.07 
 
 
289 aa  95.5  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>