More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1383 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1383  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
263 aa  525  1e-148  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
273 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
274 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.89 
 
 
285 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.68 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.5 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
284 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.51 
 
 
277 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
277 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.92 
 
 
273 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
293 aa  139  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  33.09 
 
 
283 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 
271 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.51 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.59 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.72 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.97 
 
 
300 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.19 
 
 
275 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.73 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.31 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.47 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.44 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.3 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.51 
 
 
276 aa  131  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
272 aa  131  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.79 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.42 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.27 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.4 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.85 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.42 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
286 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.5 
 
 
272 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.44 
 
 
273 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.17 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.34 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.2 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.52 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.8 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.18 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.42 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  31.92 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  31.15 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.8 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.07 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.1 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.42 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
272 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.95 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.33 
 
 
278 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.39 
 
 
266 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.61 
 
 
271 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
272 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.73 
 
 
278 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
275 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.24 
 
 
282 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.13 
 
 
272 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 
272 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.52 
 
 
275 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.63 
 
 
272 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
260 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 
279 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.08 
 
 
289 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
273 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
281 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
273 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
281 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.8 
 
 
271 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.72 
 
 
274 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
274 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>