More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2081 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2081  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
444 aa  912    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0007  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.92 
 
 
433 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.38 
 
 
436 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  42.53 
 
 
426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2470  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  39.51 
 
 
451 aa  329  7e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000450435  decreased coverage  0.000021733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0003  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  34.79 
 
 
457 aa  243  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  28.16 
 
 
449 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  26.68 
 
 
460 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  30.38 
 
 
450 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  26.58 
 
 
458 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  31.17 
 
 
445 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  28.03 
 
 
452 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  28.07 
 
 
459 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.86 
 
 
461 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  30.6 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.35 
 
 
463 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  28.78 
 
 
442 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.19 
 
 
454 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.99 
 
 
587 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.79 
 
 
476 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  30.29 
 
 
460 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  29.42 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  26.62 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.7 
 
 
591 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.34 
 
 
566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.54 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  26.79 
 
 
446 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.37 
 
 
476 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  27.23 
 
 
446 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  27.23 
 
 
446 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  27.23 
 
 
446 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  27.23 
 
 
446 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  27.23 
 
 
446 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.33 
 
 
534 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  29.43 
 
 
450 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  26.04 
 
 
446 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  26.04 
 
 
446 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  26.56 
 
 
446 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  29.43 
 
 
450 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.5 
 
 
476 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  26.63 
 
 
446 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  27.97 
 
 
448 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  27.05 
 
 
482 aa  169  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.45 
 
 
570 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.55 
 
 
506 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  24.35 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  23.82 
 
 
492 aa  167  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  27.68 
 
 
453 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  27.68 
 
 
453 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  25.84 
 
 
446 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  25.79 
 
 
457 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  25.79 
 
 
457 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  28.86 
 
 
449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.86 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.38 
 
 
527 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.96 
 
 
439 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.75 
 
 
453 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.77 
 
 
464 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.87 
 
 
527 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.54 
 
 
443 aa  166  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.36 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  24.51 
 
 
477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  25.95 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  30.23 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.89 
 
 
462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.45 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  30.1 
 
 
494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  32.49 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  27.87 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  25.66 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.59 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  24.89 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.62 
 
 
721 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  23.86 
 
 
491 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.38 
 
 
509 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  27.9 
 
 
436 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  27.33 
 
 
482 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.73 
 
 
516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  27.09 
 
 
445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.83 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  29.26 
 
 
455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  29.26 
 
 
455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  29.83 
 
 
509 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.02 
 
 
498 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.38 
 
 
442 aa  163  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.06 
 
 
450 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  26.63 
 
 
441 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12738  chromosomal replication initiation protein  23.93 
 
 
475 aa  163  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.843582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  27.61 
 
 
463 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  29.81 
 
 
506 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  29.88 
 
 
440 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.57 
 
 
457 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.36 
 
 
469 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.39 
 
 
453 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  31.3 
 
 
582 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  30.61 
 
 
505 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.03 
 
 
528 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  28.49 
 
 
453 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  30.61 
 
 
510 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.93 
 
 
458 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>