More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2470 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2470  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  100 
 
 
451 aa  936    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000450435  decreased coverage  0.000021733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2081  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.51 
 
 
444 aa  329  7e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  40 
 
 
426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.86 
 
 
436 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0007  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.68 
 
 
433 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  32.23 
 
 
442 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  31.92 
 
 
446 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  29.33 
 
 
465 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  31.92 
 
 
446 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  31.92 
 
 
446 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  31.92 
 
 
446 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  31.92 
 
 
446 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  31.92 
 
 
446 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  31.92 
 
 
446 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.08 
 
 
446 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  32 
 
 
446 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  31.22 
 
 
450 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  28.64 
 
 
445 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  29.41 
 
 
452 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.04 
 
 
463 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  31.06 
 
 
446 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  30.96 
 
 
450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.65 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
446 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.25 
 
 
461 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.42 
 
 
453 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.65 
 
 
439 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  27.75 
 
 
458 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0003  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  31.1 
 
 
457 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  30.65 
 
 
443 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  29.43 
 
 
453 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.29 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  27.4 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  28.75 
 
 
453 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  29.27 
 
 
459 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  28.75 
 
 
453 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  33.76 
 
 
453 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 
450 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  33.76 
 
 
453 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.54 
 
 
443 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  28.76 
 
 
469 aa  179  8e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.21 
 
 
444 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  30.32 
 
 
450 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
446 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 
476 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  33.97 
 
 
440 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  32.12 
 
 
457 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  30.84 
 
 
449 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  32.12 
 
 
457 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.26 
 
 
454 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  31.87 
 
 
460 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  33.13 
 
 
470 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.28 
 
 
457 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  30.9 
 
 
500 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  29.34 
 
 
441 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  34.5 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  28.07 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.56 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  30.84 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  28.89 
 
 
451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
451 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.92 
 
 
509 aa  172  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.44 
 
 
458 aa  172  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  30.03 
 
 
482 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.96 
 
 
462 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  26.4 
 
 
463 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.03 
 
 
516 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  28.33 
 
 
470 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  29.83 
 
 
465 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.19 
 
 
483 aa  170  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  30.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  33.75 
 
 
478 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 
467 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.74 
 
 
570 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  32.02 
 
 
449 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  30.32 
 
 
465 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.45 
 
 
450 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 
467 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.45 
 
 
468 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.4 
 
 
449 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0001  chromosomal replication initiation protein  32.73 
 
 
529 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0001  chromosomal replication initiation protein  32.73 
 
 
529 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0001  chromosomal replication initiation protein  31.27 
 
 
579 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.76 
 
 
442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  31.67 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  31.67 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  28.46 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  31.67 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  31.67 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  31.67 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  31.67 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  33.83 
 
 
524 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3442  chromosomal replication initiation protein  32.42 
 
 
522 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807856  normal  0.719643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.62 
 
 
527 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>