More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0007 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0007  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 433 aa  884    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2081  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.92 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.15 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  41.94 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2470  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  39.68 
 
 		 451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000450435  decreased coverage  0.000021733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0003  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  35.47 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  27.15 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.09 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  26.27 
 
 		 458 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  26.15 
 
 		 460 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  28.83 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  27.15 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  30.79 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  27.5 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.08 
 
 		 566 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  27.56 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.23 
 
 		 439 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  25.22 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.68 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.84 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.04 
 
 		 587 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  27.34 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  28.67 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.04 
 
 		 591 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.98 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  30.43 
 
 		 461 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.84 
 
 		 476 aa  159  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.04 
 
 		 721 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.83 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  29.28 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  27.19 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.86 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.16 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.04 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  29.77 
 
 		 448 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  29.07 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  27.49 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.33 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  32.54 
 
 		 582 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  25.27 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  27.73 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  27.73 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  28.5 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  28.5 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  28.5 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  28.5 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  28.5 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.4 
 
 		 528 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  28.72 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  32.54 
 
 		 597 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  28.72 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  27.89 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  29.38 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  29.38 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  30.09 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.28 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.82 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.98 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  28.25 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  28.25 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.45 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  33.23 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  23.35 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  32.84 
 
 		 615 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.29 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  29.91 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  25.97 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  30.25 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  27.96 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.57 
 
 		 470 aa  153  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000188551  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.61 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  24.71 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12738  chromosomal replication initiation protein  24.13 
 
 		 475 aa  153  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.843582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.48 
 
 		 519 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  25.05 
 
 		 471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  31.15 
 
 		 506 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  27.89 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  30.12 
 
 		 452 aa  153  7e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  31.15 
 
 		 505 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.54 
 
 		 570 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  23.25 
 
 		 492 aa  153  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  30.32 
 
 		 492 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  31.25 
 
 		 510 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.11 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  29.81 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  31.14 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.6 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  23.45 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.91 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  28.48 
 
 		 509 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.11 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000310067  unclonable  0.000054574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  31.56 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  26.7 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  26.7 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  30.75 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  23.23 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.74 
 
 		 515 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 		 511 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.46 
 
 		 480 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  30.45 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>