More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0966 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0966  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
343 aa  709    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0730  metal dependent phosphohydrolase  76.88 
 
 
351 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0424443  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1031  metal dependent phosphohydrolase  65.49 
 
 
342 aa  434  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1102  metal dependent phosphohydrolase  63.8 
 
 
347 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 
394 aa  104  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4963  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
350 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102256  normal  0.0892849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4449  metal-dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
358 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4913  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
354 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  25.95 
 
 
332 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  43.61 
 
 
405 aa  96.7  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 
452 aa  96.3  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
446 aa  94.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 
371 aa  93.2  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  37.09 
 
 
487 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 
338 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
338 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  35.1 
 
 
495 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  37.86 
 
 
453 aa  92.8  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 
328 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.35 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  37.69 
 
 
615 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  39.07 
 
 
212 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
512 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  38.3 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1513  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  40.15 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
1073 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  31.31 
 
 
421 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  37.76 
 
 
848 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
703 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 
462 aa  90.1  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  34.31 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 
618 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
505 aa  89.4  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  37.98 
 
 
465 aa  89.4  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
389 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  42.22 
 
 
771 aa  89.4  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
389 aa  89.4  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  41.79 
 
 
207 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 
492 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  42.11 
 
 
550 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 
648 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  38.22 
 
 
199 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
436 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  39.69 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  30.81 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  43.44 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  36.59 
 
 
419 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 
356 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
465 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.46 
 
 
880 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.46 
 
 
860 aa  86.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  32.98 
 
 
599 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 
703 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 
814 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 
401 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
353 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 
388 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  32.92 
 
 
642 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  32.92 
 
 
642 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  44.04 
 
 
385 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  40.91 
 
 
377 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  40.91 
 
 
373 aa  85.9  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  40.91 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  40.91 
 
 
377 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  38.93 
 
 
351 aa  85.9  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  38.06 
 
 
619 aa  85.9  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
402 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  40.91 
 
 
374 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  36.69 
 
 
220 aa  85.9  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1939  GAF domain/His kinase A domain/HD domain-containing protein  36.62 
 
 
787 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  41.07 
 
 
712 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  41.67 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 
770 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 
496 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
512 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
755 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423484  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  34.01 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  33.78 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.25 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0125166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>