84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3132 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1071  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60.09 
 
 		 259 aa  281  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1172  peptidase S14 ClpP  60.79 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3566  peptidase S14 ClpP  62.04 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000648682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  58.41 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  56.25 
 
 		 238 aa  278  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2064  peptidase S14 ClpP  61.5 
 
 		 246 aa  277  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3537  translocation-enhancing protein  61.57 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000163872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3555  translocation-enhancing protein  61.57 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3844  clp protease  61.57 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000681675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3895  clp protease  62.04 
 
 		 249 aa  276  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00193519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1404  clp protease  62.33 
 
 		 249 aa  276  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000177875  hitchhiker  0.00000000296057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3808  clp protease  61.57 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27202e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3647  hypothetical protein  61.11 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3831  hypothetical protein  61.57 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000217927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3932  hypothetical protein  61.11 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00334728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2448  peptidase S14 ClpP  62.86 
 
 		 250 aa  274  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.522439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1267  peptidase S14, ClpP  57.47 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.394394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1937  peptidase S14, ClpP  60.95 
 
 		 276 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1097  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.87 
 
 		 257 aa  267  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000231282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.85 
 
 		 280 aa  265  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1703  peptidase S14 ClpP  57.87 
 
 		 254 aa  264  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000655286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1461  peptidase S14 ClpP  62.12 
 
 		 259 aa  263  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0358067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  58.49 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  56.74 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  55.07 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  55.07 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  46.3 
 
 		 316 aa  221  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.74 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0872  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.66 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.323505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  24.48 
 
 		 552 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0700  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.23 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  22.16 
 
 		 550 aa  48.9  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1429  Endopeptidase Clp  25.87 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  20.54 
 
 		 522 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1247  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.12 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  23.04 
 
 		 612 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.73 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  24.68 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2563  endopeptidase Clp  25.69 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.9 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1899  peptidase S14, ClpP  25.69 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2392  endopeptidase Clp  25.18 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1568  Endopeptidase Clp  26.49 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463332  normal  0.0340848 
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.46 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.23 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2894  endopeptidase Clp  25.69 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421191  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0511  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  25.33 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.1021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2848  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.67 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0259579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3309  Endopeptidase Clp  25.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  21.94 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1095  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  23.73 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000583712  hitchhiker  0.00000378515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0645  Endopeptidase Clp  24.2 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1696  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.83 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0248  hypothetical protein  22.54 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2229  endopeptidase Clp  25 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1531  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  23.35 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0395  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.5 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.208207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3591  endopeptidase Clp  27.81 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0546  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.62 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1102  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.27 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1397  peptidase S49  20 
 
 		 550 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.03 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1873  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.57 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0161226  normal  0.0102896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3136  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.06 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000023514  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0691  Endopeptidase Clp  26 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.238496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1885  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.39 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  23.87 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  26.09 
 
 		 423 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1272  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.48 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1915  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.03 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.48 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.85 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0818  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.73 
 
 		 207 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0570  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.1 
 
 		 198 aa  42  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  22.73 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  25 
 
 		 583 aa  41.6  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0265  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  25 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  35.21 
 
 		 436 aa  41.6  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>