184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1649 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  99.56 
 
 
229 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  70.1 
 
 
238 aa  287  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1097  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.22 
 
 
257 aa  285  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000231282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1703  peptidase S14 ClpP  63.68 
 
 
254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000655286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  57.83 
 
 
234 aa  274  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1267  peptidase S14, ClpP  58.11 
 
 
267 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.394394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1937  peptidase S14, ClpP  57.94 
 
 
276 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1071  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  59.36 
 
 
259 aa  261  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1172  peptidase S14 ClpP  56.95 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2448  peptidase S14 ClpP  56.68 
 
 
250 aa  254  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.522439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3831  hypothetical protein  56.88 
 
 
249 aa  254  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000217927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3537  translocation-enhancing protein  57.14 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000163872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3555  translocation-enhancing protein  57.14 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3844  clp protease  57.14 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000681675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3808  clp protease  57.14 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27202e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3895  clp protease  57.14 
 
 
249 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00193519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1404  clp protease  57.14 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000177875  hitchhiker  0.00000000296057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3647  hypothetical protein  57.14 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3932  hypothetical protein  57.14 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00334728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3566  peptidase S14 ClpP  57.14 
 
 
249 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000648682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  55.25 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2064  peptidase S14 ClpP  61.86 
 
 
246 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1461  peptidase S14 ClpP  58.16 
 
 
259 aa  249  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0358067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  55.07 
 
 
230 aa  248  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  57.58 
 
 
266 aa  248  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  53.85 
 
 
280 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  54.21 
 
 
316 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.53 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.52 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.52 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.45 
 
 
196 aa  52  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1429  Endopeptidase Clp  26.28 
 
 
210 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.87 
 
 
194 aa  52  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.25 
 
 
205 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.35 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0700  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.04 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.57 
 
 
323 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.72 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.27 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.48 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  22.09 
 
 
522 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  26.49 
 
 
566 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.84 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3785  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.74 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0709  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.97 
 
 
195 aa  48.9  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.48 
 
 
207 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0374  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  30 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  22.22 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0395  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.75 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.208207  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0766  endopeptidase Clp  27.27 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000455068  hitchhiker  1.46896e-16 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.14 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  20.69 
 
 
550 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  23.38 
 
 
216 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0917  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.79 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09663  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.71 
 
 
182 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.409617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2340  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.62 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0274292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5134  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  22.73 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1928  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.25 
 
 
197 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000803868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2565  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.97 
 
 
212 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.53 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3421  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  25.97 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461069  normal  0.155928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1527  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.68 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.73019  normal  0.314697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  25.32 
 
 
198 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  20 
 
 
552 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.83 
 
 
311 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1718  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.54 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.866088  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1677  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.33 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.209719  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.51 
 
 
547 aa  46.2  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  22.08 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7405  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.03 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0357539  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  22.41 
 
 
612 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  25.16 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1873  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.27 
 
 
199 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0161226  normal  0.0102896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4545  endopeptidase Clp  27.74 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843015  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0691  Endopeptidase Clp  33.77 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.238496  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14751  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.4 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0148  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.25 
 
 
205 aa  45.4  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0054433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3136  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.67 
 
 
212 aa  45.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000023514  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.21 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.64561  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.92 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1689  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.22 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000228148  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2036  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3353  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  23.93 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1608  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.3 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191797  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1885  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.27 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11730  protease subunit of ATP-dependent protease  26.71 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533928  normal  0.37296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  23.38 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2416  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2679  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0248  hypothetical protein  31.17 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2371  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2848  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.75 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0259579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.28 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3499  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  23.93 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17351  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.21 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0322  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.15 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0872  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  22.98 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.323505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>