68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1937 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1937  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 276 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3566  peptidase S14 ClpP  69.33 
 
 		 249 aa  321  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000648682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3537  translocation-enhancing protein  69.09 
 
 		 249 aa  318  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000163872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3844  clp protease  69.09 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000681675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3555  translocation-enhancing protein  69.09 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3808  clp protease  69.09 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27202e-31 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  64.05 
 
 		 266 aa  318  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3831  hypothetical protein  69.72 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000217927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3647  hypothetical protein  68.64 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3932  hypothetical protein  68.64 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00334728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1172  peptidase S14 ClpP  69.91 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1404  clp protease  67.26 
 
 		 249 aa  315  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000177875  hitchhiker  0.00000000296057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3895  clp protease  68.66 
 
 		 249 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00193519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2448  peptidase S14 ClpP  69.41 
 
 		 250 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.522439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  67.92 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1097  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60.83 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000231282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1071  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  69.16 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1703  peptidase S14 ClpP  68.06 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000655286  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1267  peptidase S14, ClpP  65.61 
 
 		 267 aa  311  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.394394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  59.52 
 
 		 264 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2064  peptidase S14 ClpP  67.27 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1461  peptidase S14 ClpP  65.57 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0358067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  63.64 
 
 		 238 aa  298  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.09 
 
 		 280 aa  291  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  60.95 
 
 		 230 aa  271  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  57.94 
 
 		 229 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  57.48 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  51.17 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.11 
 
 		 196 aa  53.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0700  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.66 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1429  Endopeptidase Clp  27.97 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0395  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.25 
 
 		 196 aa  49.7  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.208207  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.97 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  24.6 
 
 		 552 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0645  Endopeptidase Clp  26.62 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.57 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.5 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  25.25 
 
 		 612 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.66 
 
 		 382 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.79 
 
 		 194 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.38 
 
 		 202 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  26.25 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  24.06 
 
 		 550 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.19 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.19 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3785  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  24.86 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1411  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.4 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15001  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.4 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2229  endopeptidase Clp  23.53 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0691  Endopeptidase Clp  28.72 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.238496  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15131  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.4 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  25.17 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.84 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  23.6 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.61 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14751  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.47 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0628  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.17 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  26.23 
 
 		 522 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  24.03 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2894  endopeptidase Clp  23.23 
 
 		 214 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421191  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0954  peptidase S14 ClpP  25.53 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3662  endopeptidase Clp  30.12 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.75 
 
 		 207 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1476  endopeptidase Clp  30.12 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219391  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  23.23 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.57 
 
 		 200 aa  42.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  24.73 
 
 		 583 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>