41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1172 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1172  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
245 aa  496  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2064  peptidase S14 ClpP  88.62 
 
 
246 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3647  hypothetical protein  78.3 
 
 
249 aa  380  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1404  clp protease  75.83 
 
 
249 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000177875  hitchhiker  0.00000000296057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3932  hypothetical protein  78.3 
 
 
249 aa  380  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00334728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2448  peptidase S14 ClpP  75.31 
 
 
250 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.522439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3831  hypothetical protein  78.3 
 
 
249 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000217927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3844  clp protease  78.3 
 
 
249 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000681675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3566  peptidase S14 ClpP  76.99 
 
 
249 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000648682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3808  clp protease  78.3 
 
 
249 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27202e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3555  translocation-enhancing protein  78.3 
 
 
249 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3537  translocation-enhancing protein  78.3 
 
 
249 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000163872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3895  clp protease  76.69 
 
 
249 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00193519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  72.56 
 
 
234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1937  peptidase S14, ClpP  69.91 
 
 
276 aa  317  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1267  peptidase S14, ClpP  65.52 
 
 
267 aa  315  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.394394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1071  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  68.69 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1461  peptidase S14 ClpP  64.44 
 
 
259 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0358067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1097  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.29 
 
 
257 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000231282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1703  peptidase S14 ClpP  61.34 
 
 
254 aa  307  8e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000655286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  63.11 
 
 
238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  64.89 
 
 
266 aa  304  9.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  61.6 
 
 
264 aa  304  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.36 
 
 
280 aa  300  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  60.79 
 
 
230 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  56.95 
 
 
229 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  56.5 
 
 
229 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  54.07 
 
 
316 aa  245  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.22 
 
 
311 aa  48.5  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0954  peptidase S14 ClpP  25.93 
 
 
355 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.6 
 
 
265 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0700  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.75 
 
 
199 aa  45.4  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.19 
 
 
331 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  26.67 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  25.97 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1429  Endopeptidase Clp  24.68 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  22.29 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1336  peptidase S49  26.59 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  22.73 
 
 
202 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  25.14 
 
 
200 aa  42  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>