76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1267 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1267  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.394394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1071  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  72.85 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1097  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  72.22 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000231282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  71.98 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  72.82 
 
 		 234 aa  326  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  68.66 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2064  peptidase S14 ClpP  65.2 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3647  hypothetical protein  69.2 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3932  hypothetical protein  69.2 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00334728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3555  translocation-enhancing protein  69.2 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3808  clp protease  69.2 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27202e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3844  clp protease  69.2 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000681675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3831  hypothetical protein  69.2 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000217927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3537  translocation-enhancing protein  72.25 
 
 		 249 aa  316  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000163872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1404  clp protease  69.2 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000177875  hitchhiker  0.00000000296057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3566  peptidase S14 ClpP  72.73 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000648682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2448  peptidase S14 ClpP  68 
 
 		 250 aa  315  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.522439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3895  clp protease  72.25 
 
 		 249 aa  315  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00193519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1172  peptidase S14 ClpP  65.52 
 
 		 245 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1703  peptidase S14 ClpP  66.52 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000655286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1937  peptidase S14, ClpP  65.61 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  65.94 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.73 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1461  peptidase S14 ClpP  64.95 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0358067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  57.47 
 
 		 230 aa  272  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  58.11 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  58.11 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  54.55 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0700  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.66 
 
 		 199 aa  52.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.75 
 
 		 200 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.62 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.93 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.45 
 
 		 201 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.38 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.37 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1941  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.78 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  24.29 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.62 
 
 		 203 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3136  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.09 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000023514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0306  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.05 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844592  normal  0.63492 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  23.44 
 
 		 200 aa  45.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.02 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.62 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.12 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0570  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  25 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.62 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0872  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.91 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.323505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  25.32 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.62 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  22.71 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.4 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2234  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.65 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.12 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1718  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  26.32 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.866088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.75 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3785  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.67 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.39 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  21.7 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0395  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.5 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.208207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.62 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  25 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3132  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.39 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  19.78 
 
 		 522 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  23.32 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  26.4 
 
 		 601 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2848  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.78 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0259579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  26.46 
 
 		 616 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  26.46 
 
 		 616 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.47 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1095  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  22.73 
 
 		 207 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000583712  hitchhiker  0.00000378515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1230  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.45 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000738057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1429  Endopeptidase Clp  25.81 
 
 		 210 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3068  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  24.86 
 
 		 207 aa  42  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.201714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  25.51 
 
 		 566 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0904  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.29 
 
 		 207 aa  42  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000979846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>