38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1703 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1703  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000655286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1097  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  71.31 
 
 
257 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000231282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1404  clp protease  61.85 
 
 
249 aa  323  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000177875  hitchhiker  0.00000000296057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3555  translocation-enhancing protein  61.45 
 
 
249 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3808  clp protease  61.45 
 
 
249 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27202e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3844  clp protease  61.45 
 
 
249 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000681675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3831  hypothetical protein  61.45 
 
 
249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000217927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3537  translocation-enhancing protein  62.55 
 
 
249 aa  318  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000163872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3647  hypothetical protein  61.04 
 
 
249 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3932  hypothetical protein  61.04 
 
 
249 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00334728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3566  peptidase S14 ClpP  62.55 
 
 
249 aa  315  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000648682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  67.12 
 
 
238 aa  315  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  65.02 
 
 
234 aa  314  7e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1937  peptidase S14, ClpP  68.06 
 
 
276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1267  peptidase S14, ClpP  66.52 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.394394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2448  peptidase S14 ClpP  61.76 
 
 
250 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.522439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3895  clp protease  61.04 
 
 
249 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00193519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1071  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.58 
 
 
259 aa  308  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1172  peptidase S14 ClpP  61.34 
 
 
245 aa  307  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  63.16 
 
 
266 aa  300  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2064  peptidase S14 ClpP  65.09 
 
 
246 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  62.17 
 
 
264 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1461  peptidase S14 ClpP  60.17 
 
 
259 aa  292  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0358067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.61 
 
 
280 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  63.68 
 
 
229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  63.68 
 
 
229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  57.87 
 
 
230 aa  264  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  56.4 
 
 
316 aa  257  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1429  Endopeptidase Clp  24.68 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  24.67 
 
 
552 aa  46.2  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  22.7 
 
 
552 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  21.93 
 
 
550 aa  45.8  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.6 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0766  endopeptidase Clp  26.11 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000455068  hitchhiker  1.46896e-16 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  21.2 
 
 
612 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  20.33 
 
 
522 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  22.11 
 
 
601 aa  42  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  26.89 
 
 
200 aa  42  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>