31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2759 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
316 aa  636    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1097  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.64 
 
 
257 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000231282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  58.1 
 
 
238 aa  261  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1703  peptidase S14 ClpP  56.4 
 
 
254 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000655286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  52.19 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1937  peptidase S14, ClpP  51.17 
 
 
276 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1172  peptidase S14 ClpP  52.23 
 
 
245 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  56.54 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  54.12 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  53.3 
 
 
229 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  53.3 
 
 
229 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1267  peptidase S14, ClpP  54.38 
 
 
267 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.394394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2064  peptidase S14 ClpP  49.15 
 
 
246 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3566  peptidase S14 ClpP  50 
 
 
249 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000648682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1071  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  51.9 
 
 
259 aa  241  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3647  hypothetical protein  50.7 
 
 
249 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3932  hypothetical protein  50.7 
 
 
249 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00334728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3537  translocation-enhancing protein  50.23 
 
 
249 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000163872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3844  clp protease  50.23 
 
 
249 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000681675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3895  clp protease  50.7 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00193519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1404  clp protease  50.7 
 
 
249 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000177875  hitchhiker  0.00000000296057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3808  clp protease  50.23 
 
 
249 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27202e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3555  translocation-enhancing protein  50.23 
 
 
249 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3831  hypothetical protein  50.23 
 
 
249 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000217927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2448  peptidase S14 ClpP  49.31 
 
 
250 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.522439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  44.62 
 
 
266 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1461  peptidase S14 ClpP  52.02 
 
 
259 aa  232  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0358067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  45.78 
 
 
230 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.4 
 
 
210 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0199  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  23.78 
 
 
198 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0248  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>