15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0248 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1553  endopeptidase Clp  29.6 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  23.81 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0079  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.24 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  23.81 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3404  endopeptidase Clp  29.6 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  25.52 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  27.69 
 
 		 620 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  22.54 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  25.16 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 316 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0615  Endopeptidase Clp  23.48 
 
 		 202 aa  42  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0446476  normal  0.853287 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0265  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  23.48 
 
 		 205 aa  42  0.008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  25.53 
 
 		 266 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  20.67 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>