174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2165 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
187 aa  381  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  65.24 
 
 
188 aa  268  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  65.78 
 
 
188 aa  268  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  65.38 
 
 
182 aa  261  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  55.38 
 
 
187 aa  214  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
185 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
185 aa  117  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
185 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 
190 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
181 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
182 aa  88.2  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 
189 aa  87  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
182 aa  85.5  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
197 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
185 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0694  phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
179 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  25.52 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
190 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  27.47 
 
 
197 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  27.48 
 
 
174 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
172 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  27.65 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  22.58 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  25.52 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 
173 aa  48.5  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  25.64 
 
 
500 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
168 aa  47.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 
197 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
235 aa  47.8  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
213 aa  47.8  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  23.57 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
173 aa  47  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
170 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  23.75 
 
 
190 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
232 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  23.57 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  27.2 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  25.38 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  26.52 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
169 aa  45.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>