More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1847 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  70 
 
 
182 aa  255  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  69.44 
 
 
182 aa  238  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  56.15 
 
 
187 aa  207  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
182 aa  203  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
185 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  53.23 
 
 
185 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
185 aa  193  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  55.8 
 
 
190 aa  193  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  53.23 
 
 
185 aa  192  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  54.95 
 
 
183 aa  191  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
190 aa  191  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
189 aa  186  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
189 aa  185  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
181 aa  177  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 
185 aa  176  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
189 aa  176  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  47.28 
 
 
189 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  49.74 
 
 
190 aa  174  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  46.74 
 
 
189 aa  174  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  51.65 
 
 
186 aa  153  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  101  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
182 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 
188 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  35 
 
 
187 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
181 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
190 aa  60.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
183 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
183 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  28.37 
 
 
206 aa  58.2  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
183 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
172 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
187 aa  58.2  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  31.82 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
181 aa  57.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 
174 aa  57.8  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 
187 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
186 aa  57.8  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>