180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4088 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  98.94 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  98.9 
 
 		 182 aa  364  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  65.78 
 
 		 187 aa  268  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  59.14 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  36.72 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  35.43 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  34.18 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  34.73 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0694  phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  23.84 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  33.08 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  24.24 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  23.86 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  27.47 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  25.53 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  27.59 
 
 		 479 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  27.59 
 
 		 479 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  25.13 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  25.76 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  23.03 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  23.18 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  23.3 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  25.27 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  24.11 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>